Федеральное агентство
научных организаций

ИНСТИТУТ БЕЛКА РАН

Краткое описание arrow Группа регуляции биосинтеза белка
телефон: 8(4967)31-84-38

Сотрудники группы

к.б.н.   В. М. Евдокимова
к.б.н.   Д. Н. Лябин
к.б.н.   С. Г. Гурьянов
к.б.н.   И. А. Елисеева
асп.     Д. А. Кретов
асп.     Д.А. Мордовкина
асп.     Д. Н. Поляков
асп.     А.Н. Доронин 
инж.    Е.А.Соболева
инж.    Е.В.Сереброва

Лев Павлович Овчинников
Кандидат биологических наук с 1969 г.
Доктор биологических наук с 1982 г.
Профессор Московского государственного университета с 1987 г.
Академик РАН с 1997 г.
Руководитель группы с 1981 г.
Директор Института белка РАН с 2001 г.
Группа регуляции биосинтеза белка
 
Основные научные достижения

Важная роль в регуляции экспрессии генов у эукариот принадлежит белкам, ассоциированным с молекулами мРНК и входящим в состав цитоплазматических мРНП (информосом). Мы сосредоточили наше внимание на YB-1 – мажорном белке мРНП, ассоциированном с большинством мРНК. YB-1 связывается с молекулами мРНК во время их синтеза на хромосомах и сопровождает мРНК на протяжении всей их жизни. Этот белок взаимодействует не только с мРНК, но и с ДНК, и участвует практически во всех ДНК-зависимых процессах, включая репликацию, репарацию, рекомбинацию и транскрипцию. Наша группа клонировала кДНК YB-1 кролика и определила первичную структуру этого белка. Мы показали, что:

  • YB-1 упаковывает мРНК в мРНП, лабилизует вторичную структуру мРНК и ремоделирует мРНП, определяя трансляционный статус мРНК и регулируя время жизни мРНК в клетке, а также ее локализацию на внутриклеточном актиновом скелете;
  • синтез YB-1 находится под негативным контролем самого YB-1 и под позитивным контролем поли(А)-связывающего белка (PABP);
  • переход YB-1 в клеточное ядро вызывается генотоксическими стрессами и обусловлен укорочением YB-1 с С-конца под действием 20S протеасомы.

 

Перспективы исследований
  • Исследовать молекулярные механизмы, регулирующие синтез белка YB-1, его биологические активности и ядерно-цитоплазматическое распределение.
  • Исследовать роль белка YB-1 в раковой трансформации клеток и в возникновении у них множественной лекарственной устойчивости.
  • Разработать новые подходы к раннему выявлению множественной лекарственной устойчивости и ее преодолению, а также к диагностике и терапии раковых заболеваний с использованием YB-1.
 

 Последние опубликованные работы

2016
  Lyabin D.N. and Ovchinnikov L.P. (2016) Selective regulation of YB-1 mRNA translation by the mTOR signaling pathway is not mediated by 4E-binding protein. Sci Rep. Mar 2;6:22502. pdf  
 
2015
  Bobkova N.V., Lyabin D.N., Medvinskaya N.I., Samokhin A.N., Nekrasov P.V., Nesterova I.V., Aleksandrova I.Y., Tatarnikova O.G., Bobylev A.G., Vikhlyantsev I.M., Kukharsky M.S., Ustyugov A.A., Polyakov D.N., Eliseeva I.A., Kretov D.A., Guryanov S.G., Ovchinnikov L.P. (2015) The Y-Box Binding Protein 1 Suppresses Alzheimer's Disease Progression in Two Animal Models. PLoS One.;10(9):e0138867. pdf  
  Boca M., Kretov D.A., Desforges B., Mephon-Gaspard A., Curmi P.A., Pastré D. (2015). Probing protein interactions in living mammalian cells on a microtubule bench. Sci Rep. 27, 5, 17304. pdf  
  Laman AG, Lathe R, Savinov GV, Shepelyakovskaya AO, Boziev KhM, Baidakova LK, Chulin AN, Brovko FA, Svirshchevskaya EV, Kotelevtsev Y, Eliseeva IA, Guryanov SG, Lyabin DN, Ovchinnikov LP, Ivanov VT. (2015) Innate immunity: Bacterial cell-wall muramyl peptide targets the conserved transcription factor YB-1. FEBS Lett. Jul 8;589(15):1819-24. PubMed  
   Fomina E.E., Pestryakov P.E., Kretov D.A., Zharkov D.O., Ovchinnikov L.P., Curmi P.A., Lavrik O.I. (2015) Inhibition of abasic site cleavage in bubble DNA by multifunctional protein YB-1. J Mol Recognit, 28(2):117-23. PubMed 
  Kretov D.A., Curmi P.A., Hamon L., Abrakhi S., Desforges B., Ovchinnikov L.P., Pastré D. (2015) mRNA and DNA selection via protein multimerization: YB-1 as a case study. Nucleic Acids Res.; 43(19):9457-73. pdf 
  Kljashtorny V, Nikonov S, Ovchinnikov L, Lyabin D, Vodovar N, Curmi P, Manivet P. (2015) The Cold Shock Domain of YB-1 Segregates RNA from DNA by Non-Bonded Interactions. PLoS One; 10(7):e0130318. pdf 
  Alemasova E.E., Pestryakov P.E., Sukhanova M.V., Kretov D.A., Moor N.A., Curmi P.A., Ovchinnikov L.P., Lavrik O.I. (2015) Poly(ADP-ribosyl)ation as a new posttranslational modification of YB-1. Biochimie. 119:36-44. PubMed  
  Fomina EE, Pestryakov PE, Maltseva EA, Petruseva IO, Kretov DA, Ovchinnikov LP, Lavrik OI. (2015) Y-box binding protein 1 (YB-1) promotes detection of DNA bulky lesions by XPC-HR23B factor. Biochemistry (Mosc). Feb;80(2):219-27. pdf  
 
2014
  Bogolyubova I.O., Lyabin D.N., Bogolyubov D.S. and Ovchinnikov L.P. (2014). Immunocytochemical study of YB-1 nuclear distribution in different cell types. Tissue and Cell. PubMed 
  Lyabin D.N., Doronin A.N., Eliseeva I.A., Guens G.P., Kulakovskiy I.V. and Ovchinnikov L.P. (2014). Alternative Forms of Y-Box Binding Protein 1 and YB-1 mRNA. PLOS ONE, 9, 8. PubMed 
  Lyabin D.N., Eliseeva I.A. and Ovchinnikov L.P. (2014). YB-1 protein: Function and regulation. WIREs RNA 5(1): 95-110. PubMed
  Пестряков П.Е., Фомина Е.Э., Кутузов М.М., Ходырева С.Н., Курми П., Шрайбер В., Овчинников Л.П., Лаврик О.И. (2014). Репарация апуриновых/апиримидиновых сайтов: участие поли (АДФ-рибозо)полимераз 1, 2 и мультифункционального белка YB-1. Вестник РФФИ 1 (81) январь-март 2014. Тематический блок, посвященный международным проектам РФФИ: 56-63. РФФИ 

2013
Moiseeva N. I., Stromskaya T. P., Rybalkina E. Yu., Vaiman A. V., Malyshkina M. A., Kim E. P., Eliseeva I. A., Kulakovskiy I. V., Ovchinnikov L. P. and Stavrovskaya A. A. (2013) Effects of Extracellular YB-1 Protein on Cultured Cells of Human Breast Cancer. Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, 7(1): 21–28. eLIBRARY 
Guryanov S.G., Filimonov V.V., Timchenko A.A., Melnik B.S., Kihara H., Kutyshenko V.P., Ovchinnikov L.P. and Semisotnov G.V. (2013). The major mRNP protein YB-1: structural and association properties in solution. Biochim Biophis Acta – Proteins and Proteomics, 1834 (2): 559-567. PubMed
Лябин Д.Н., Нигматуллина Л.Ф., Доронин А.Д., Елисеева И.А., Овчинников Л.П. (2013). Идентификация белков, специфически взаимодействующих с 3’-нетранслируемой областью мРНК YB-1, и исследование влияния белка hnRNP Q на трансляцию мРНК YB-1. Биохимия 78 (6): 740-750. eLIBRARY
Рыбалкина Е.Ю., Стромская Т.П., Овчинников Л.П., Ставровская А.А. (2013). Связь внутриклеточной локализации белка YB-1 в культурах клеток опухолей человека с множественной лекарственной устойчивостью. Вопросы онкологии, 59 (5): 623-628. eLIBRARY
Kim E.R., Selytina A.A., Buldakov I.A., Evdokimova V.M., Ovchinnikov L.P. and Sorokin A.V. (2013). The proteolytic YB-1 fragment interacts with DNA repair machinery and enhances survival during DNA-damaging stress. Cell cycle, 12(24): 1-13. PubMed
Елисеева И.А., Лябин Д.Н., Овчинников Л.П. (2013). Поли(А)-связывающие белки: строение, функции и регуляция активности. Успехи биол. химии т. 53:3-34. pdf


2012
  Lyabin D.N., Eliseeva I.A. and Ovchinnikov L.P. (2012).YB-1 synthesis is regulated by mTOR signaling pathway. PLOS ONE 7, 12, e52527:1-11. PubMed
  Eliseeva I.A., Ovchinnikov L.P., and Lyabin D.N. (2012). Specific PABP effect on translation of YB-1 mRNA is neutralized by polyadenilation through a “mini-loop” at 3’ UTR. RNA Biol. 9, 12: 1473-1487. PubMed
  Моисеева Н.И., Стромская Т.П., Рыбалкина Е.Ю., Вайман А.В., Малышкина М.А., Ким Е.Р., Елисеева И.А., Кулаковский И.В., Овчинников Л.П., Ставровская А.А. (2012) Влияние внеклеточного белка YB-1 на культивируемые клетки опухолей молочной железы. Биологические мембраны 29, №5: 340-348.
  Stavrovsaya A., Stromskaya T., Rybalkina E., Moiseeva N., Vaiman A., Guryanov S.G., Ovchinnikov L.P., Guens G. (2012). YB-1 protein and multidrug resistance of tumor cells. Current Signal Transduction Therapy 7, 3: 237-246. Bentham Science
  Guryanov S.G., Selivanova O.M., Nikulin A.D., Enin G.A., Kretov D.A., Serdyuk I.N., Ovchinnikov L.P. (2012). Formation of amyloid-like fibrils by Y-box binding protein 1 (YB-1) is mediated by its cold shock domain and modulated by disordered terminal domains. PLoS ONE 7, 5, e36969. PubMed
  Pestryakov P.E., Khodyreva S.N., Curmi P.A., Ovchinnikov L.P., Lavrik O.I. (2012) Effect of multifunctional protein YB-1 on the AP site cleavage by AP endonuclease 1 and tyrosyl phosphodiesterase 1. Biopolymers and Cell 28, 4: 317-321. pdf
  Pestryakov P., Zharkov D.O., Grin I., Fomina E.E., Kim E.R., Hamon L., Eliseeva I.A., Petruseva I.O., Curmi P.A., Ovchinnikov L.P., Lavrik O.I. (2012). Effect of the multifunctional proteins RPA, YB-1, and XPC repair factor on AP site cleavage by DNA glycosylase NEIL1. J. Mol. Recognit. 25, 4: 224-233. PubMed


Патенты

Бобкова Н.В., Овчинников Л.П., Медвинская Н.И., Гурьянов С.Г., Нестерова И.В., Елисеева И.А. Самохин А.Н., Александрова И.Ю. Некрасов П.В. (2015). Изобретение «Применение белка YB-1 и его фрагментов для изготовления лекарственных средств при лечении болезни Альцгеймера». Патент на изобретение №2561050

Ключевые публикации

  Evdokimova V., Ruzanov P., Imataka H., Raught B., Svitkin Yu., Ovchinnikov L.P., and Sonenberg N. (2001) The major mRNA-associated protein YB-1 is a potent 5’ capdependent mRNA stabilizer. EMBO J. 20, 5491-5502. PubMed
  Skabkin M.A., Evdokimova V., Thomas A.A.M., and Ovchinnikov L.P. (2001) The major mRNP protein p50 (YB-1) promotes nucleic acid strand annealing. J. Biol. Chem. 276, 44841-44847. PubMed
  Nekrasov M.P., Ivshina M.P., Chernov K.G., Kovrigina E.A., Evdokimova V.M., Thomas A.A.M., Hershey J.W.B., and Ovchinnikov L.P. (2003) The mRNA-binding protein YB-1 (p50) prevents association of the initiation factor eIF4G with mRNA and inhibits protein synthesis at the initiation stage. J. Biol. Chem. 278, 13936-13943.  PubMed
 

© 1996-2017 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт белка Российской академии наук
При перепечатке текстовой информации и фотографий ссылка на сайт обязательна.

Яндекс.Метрика